Bei mir waren nur bestimmte Mods betroffen:
Homemaker
Settlement Keywords
Spring Cleaning
Robot Home Defense
Amor Keywords
auch eine Neuinstallation besagter Mods ging ebenfalls nicht mehr. Alle anderen schienen von dem Beta zumindest bei mir nicht betroffen zu sein. Nachdem ich die Beta wieder rausgenommen hatte gingen alle wieder. Irgendwo habe ich auch gelesen das dieses wohl Absicht sei das die deaktiviert wurden damit die Beta besser getestet werden könnte. Das war entweder bei Nexus auf der Startseite oder in einer der Steam Diskussionen zum Survival.