Wie @Zaramnor schon geschrieben hat, funktionieren Mods im Survivalmodus durchaus. Ich spiele selbst in diesem Modus und habe einige Mods aktiviert. Allerdings wird ein neuer Eintrag bei den Spielcharakteren angelegt. Ersichtlich an einem Zusatz hinter dem Charnamen in eckigen Klammern; [Modded] oder [Gemodded] <= bin mir bei der genauen Bezeichnung grade nicht ganz sicher.
Evtl. also einfach mal in die Auswahl der Spielcharakter reinschauen (am PC die Taste "T" im Ladebildschirm).
Einschränkung mit gemoddeden Spielstand in Survival ist (wie sonst auch), dass die Erfolge deaktiviert bzw. keine neuen mehr freigeschaltet werden können.